邱辉看到郑军人心惊慌，他认为，现在最关键的是要稳定士气，所以他再次挺身而出，请求乘退潮之机，前去冲击清军，采取积极防御的政策。
刘国轩坚信日内必有大风，仍然拒绝了邱辉的请求，仍按兵不动，仅发布命令驰告各地将士小心防御。刘国轩部属二万多人、战船二百余艘，等待着猛扑而来的施琅。
关于为什么刘国轩这么有信心认为大风回来，这个问题我也搞不太清楚。我只知道刘国轩因此一次又一次地丧失了战役的主动权。
因为就在刘国轩苦等天赐大风的时候，施琅正在紧张地做着进攻前的战斗部署。他召集各船将领于旗舰上，在桌上用大米堆集成澎湖岛各处的地势，一一讲解，并严申：不用命者必按军法处置。六月十六日，清军抵近澎湖本岛，施琅下达了进攻命令，平定台湾的第一役在澎湖正式打响了。
这次战役，是自从朱元璋陈友谅鄱阳湖水战之后，三百年来中华大地上的第二次大规模水战，也是中国古代历史上唯一一次大规模海战。由于大海天气的多变，相比鄱阳湖水战，它更是加入了无数的变量。
施琅军中，果断接下先锋印的蓝理同志确实勇不可当，他一马当先，率领七艘战船率先冲入郑军船阵，击沉和焚毁郑军战船多艘。
当时正好涨潮，清军数船争先，未能保持好战斗队形，互相冲撞，不成行列，有几艘船被潮水冲近炮城，郑军乘机集中火力轰击，并集中战船一起出来围攻。
看到蓝里要吃亏，施琅身先士卒，也亲自率领船队冲入敌阵，救出数船，力战得脱。
就在这紧要关口，刘国轩盼望的大风真的发生了。
一时间怒涛山立，蓝理所率水师前锋船簸荡漂散，战斗阵形被狂风打乱，遭到郑军船舰四面围攻，形势危急。
这个时候，施琅平常的训练和战士们的勇气发挥了巨大的作用。
看到这个情况，施琅毫不畏惧，他直接率领他的部队冲击敌船。看到施琅冲过来，郑军确实是久经海军经验丰富，郑军阵中的右武卫林升率领好几艘艘战船合攻施琅，施琅的旗舰陷入重围之中。
危急时刻，先锋蓝理望见施琅受困，也率船冲入重围，接连击毁三艘敌船。
所谓软的怕硬的,硬的怕穷的，穷的怕横的,横的怕愣的,愣的怕不要命的。
面对不要命的蓝理，郑军战船全部都不敢向前了。这样主帅、先锋得以联手攻敌。
根据当时的目击者回忆（可能有夸张的成分，因为有些