原太极死后的十万年，宇宙一直维持着和平与安定，这十万年，可以说是变形金刚的黄金时期，他们锐意进取，蓬勃发展，各个星系呈现着一片欣欣向荣的局面。
流传下来的历史文本，都曾对这个时期着墨不少，似乎都在为后世描绘变形金刚在这个时期所取得的辉煌，其中有一处非常引人注目：
“从塞伯坦到银河系，我们的先辈用了数百万年，而如今的十大星际联盟，它们比起银河系，有过之而无不及，我们只用了十万年。这新诞生的十大星系，就如银河系的十个孩子，它们继承了银河系的美丽祥和，在宇宙的四处，绽放出让人惊艳的灿烂之花。宇宙中的所有种族以及文明，他们慕名而来，都愿意臣服在我们的伟大的旗帜之下，纵使宇宙浩瀚无边，我们的威名也已经随着万民的呼声传遍了最遥远的角落。如古老的预言所示，在我们君临宇宙之时，所有人都会呼喊我们的名字，这种强音足以穿透历史，向我们伟大的先辈报以崇高的敬礼，同时也让后世知道，我们曾站在宇宙的顶点！”
然而，这种和平而且充满生机的局面，却因为一个人的出现而打破了。
他是十大星际联盟中最为强大的飞虹系的最高领袖，历史上像他这样毁誉参半的人并不多见，有人说他是暴君，有人说他是圣主，然而不管怎样，他绝对是变形金刚历史上最具野心的领袖，在成为飞虹系的领袖之前，他便已经开始觊觎整个宇宙了，毫无疑问，他具有与众不同的眼界与见识，而且，他勇敢而足智多谋，冷酷而富有魅力，他长着一副令人生畏的面孔，同时他也有一个令人生畏的名字：巨无霸。
成为飞虹系的最高领袖之后，他立即有了一个大动作，那就是大星际联盟计划。表面上，这个计划是为了更好地沟通联系各大星系，共同发展共同繁荣，为的是为各个星系谋取更大的经济利益；然而实际上，这是他实现野心的第一步，组建大星际联盟，他的着眼点是在军事，为的是谋求更大的军事主导权。
在他的主导下，大星际联盟计划得到了六个星系的支持，最后他如愿以偿地当上大星际联盟的主席，这个位置相当于这个星际联盟中的最高权力，就这样，他把七个星系的军事领导权收入了囊中。
成立大星际联盟之后，他开始对反对这个计划的星系进行报复，首先是经济上的制裁，然而在他看来，经济上的制裁不过是挑起矛盾的幌子，他的目的，从一开始就是战争。
为了反对他的制裁，剩余的四个星系也结成了联盟，自此，两大阵营开始针锋相对，明争暗斗。
这样的状态一直持续了十多年，这十多年间，双方在经济上互相倾扎，双方都损失惨重，仇恨就是这样形成了，无论在什么时代什么地方，仇恨始终是战争最大的推手，很自然而然地，后来就发生了战争，刚开始是小规模的冲突，后来慢慢演变成大战。
历史走到这里，已然改变了脉络，随着两大阵营的战争，一直和平而安定的变形金刚世界开始改变模样，从此拉开了漫长的战乱时代的序幕。
这场大战波及了所有的星际联盟，就连变形金刚的故乡银河系也未能幸免，战争持续了数十万年，延续了整整二十代人。
战争是文明之敌，这是毋庸置疑的，许多文明的停滞不前、倒退甚至消亡，都已经证明了这一点，然而没有人会想到，这场大战最后演变成了对火种源以及火种源克隆体的争夺，其时对战争的双方来说，夺得火种源以及火种源克隆体就代表着永远的胜利。火种源和火种源克隆体是变形金刚的命脉所在，战火蔓延到它们身上，已经表明战争已然无法阻挡，没有人能改变它，也没有人能阻止它，于是，也便没有人能改变或者阻止变形金刚最后的必然的命运。
对于这场大战的详细情况，流传下来的历史文本曾有非常细致的描述，这些描述，在漫长的岁月里，仿佛总是在述说着同一个故事，因为战争所带来的无非是毁灭与死亡。
这是一场没有赢家的战争，在数十万年的战争中，火种源以及所有的火种源克隆体都遗失在时空的漩涡里，而守护火种源克隆体的十艘神级战舰，毁灭的毁灭，没有毁灭的也遗失在不为人知的角落里了。
巨无霸亲自发动的这场战争，他原本的目的本是统治宇宙，然而让他没有想到的是，他亲手把变形金刚这个宇宙最强大的种族推上了绝路。火种源以及所有的火种源克隆体的遗失，意味着变形金刚失去了生命的源泉，等待他们的只有老化、生锈以及枯萎的命运。
变形金刚在漫长的岁月里所创造的文明，几乎也毁于一旦，那些原先臣服在他们麾下的种族，随着变形金刚的消亡，也都纷纷各占山头自立为王，曾经有序祥和的宇宙，随着大战的结束，变成了像一锅粥那样的混乱。
对于变形金刚的这段漫长的历史，后来的历史学家曾这样分门别类，他们把战争爆发前的那段长达数百万年的历史称为宇宙第一纪元，把整个战争中的数十万年称为宇宙第二纪元，而自战争后的时间就称为宇宙第三纪元。
而在宇宙第三纪元中，变形金刚昔日的辉煌已经远去了，剩下的大约是最后一代的变形金刚，这时的他们，按种族聚居，零星地分散在宇宙的各处，他们占据着昔日由变形金刚建造的巨大的金属星球，依靠着昔日变